Pokémon Shuffle jest grą free-to-play, co oznacza, że można ją pobrać za darmo, ale są w niej dostępne płatne elementy. W tym przypadku dostępny do kupienia jest Jewel, czyli Klejnot, który można zamienić na umożliwiające grę serduszka lub pozwalające na nabywanie "wspomagaczy" monety. Poniżej przedstawiamy cenniki z obu wersji gry (komórkowo-tabletowej i konsolowej), w których zawarte są informacje ile kosztuje określona ilość Klejnotów oraz ile serduszek lub monet możemy za nie otrzymać.
Pokémon Shuffle (Nintendo 3DS)
| Ceny Klejnotów | |
| Klejnotów | Cena |
| x1 | 4,00 zł |
| x6 (5+1) | 20,00 zł |
| x12 (9+3) | 36,00 zł |
| x35 (25+10) | 100,00 zł |
| x75 (48+27) | 190,00 zł |
| Wymiana Klejnotów na serduszka i monety | ||
| Klejnotów | Serduszek | Monet |
| 1 | 5 | 3000 |
| 3 | 18 | 10000 |
| 6 | 38 | 22000 |
| 12 | 80 | 48000 |
Pokémon Shuffle Mobile
W tej wersji gry zawarty jest limit transakcji - w ciągu jednego miesiąca kalendarzowego można wydać maksymalnie 354,41 zł.
| Ceny Klejnotów | |
| Klejnotów | Cena |
| x1 | 4,27 zł |
| x6 (5+1) | 21,30 zł |
| x10 (8+2) | 33,84 zł |
| x26 (20+6) | 84,62 zł |
| x56 (40+16) | 169,21 zł |
| Wymiana Klejnotów na serduszka i monety | ||
| Klejnotów | Serduszek | Monet |
| 1 | 6 | 4000 |
| 3 | 20 (+11%) | 13000 (+8%) |
| 6 | 42 (+16%) | 28000 (+16%) |
| 12 | 87 (+20%) | 58000 (+20%) |