W Pokemon Emerald gdy udamy się pierwszy raz na pustynię, pierwszą rzeczą którą ujrzymy jest wieża, której nie było w poprzednich częściach.

By przejść tą wieżę potrzebny jest Mach Bike i Rock Smash. By przejechać przez pękniętą ziemię wystarczy tylko rozpędzić się na Mach Biku z odległości 3 kratek.
Na ostatnim piętrze Mirage Tower znajdujemy 2 skamieliny, i sytuacja się powtarza tak jak i w Pokemon R/S. Wybieramy jedną, a druga znika. Tyle że rozpada się cała wieża :)
Jednak po pokonaniu Elite 4 odblokuje się nam następna arena, znana jako Desert Underpass.
Jedziemy do Fosill Maniaca(To u niego dostaliśmy TM z Digiem), i okazuje się że dokopał się on do jakiegoś terenu. Wchodzimy w jaskinię za nim.
Jest to po prostu długi tunel, a na jego końcu czeka na nas druga skamielina.