Pokemony, które znajdują się w grotach, często posiadają ukrytą zdolność inną od tej, którą kieszonkowy potwór zna złapany na innym obszarze. Oprócz tego możemy bezpośrednio znaleźć jakiś przedmiot będąc w środku lub za pomocą Dowsing MCHN.
Zawartość grot zmienia się. Gdy zrobimy 256 kroków w grze, jest 5% szans że każda Grota się zregeneruje. Kiedy to się stanie istnieje 40% szansy na item, 40% szans na ukryty przedmiot i 20% na Pokemona.Ukryte groty znajdują się w następujących obszarach:
- Route 2
- Route 3
- Route 5
- Route 6
- Route 7
- Route 9
- Route 13
- Route 18
- Route 22
- Route 23
- Floccesy Ranch
- Pinwheel Forest
- Lostlorn Forest
- Giant Chasm
- Abundant Shrine
Przedmioty do znalezienia we wszystkich grotach
 Damp Mulch |
 Growth Mulch |
 Stable Mulch |
 Gooey Mulch |
 Repel |  Super Repel |  Max Repel |  Poke Ball |
 Great Ball |  Ultra Ball |  Potion |  Super Potion |
 Hyper Potion |
 TinyMushroom |  Big Mushroom |  Rare Candy |
 PP-Up |  PP Max |  Red Shard |  Green Shard |
 Yellow Shard |  Blue Shard |
||
Przedmioty do znalezienia w konkretnych grotach
| Route 2, 3, 5, 6, 7, 9, Floccesy Ranch | |||
 Fire Stone |
 Water Stone |  Thunderstone |  Leaf Stone |
| Route 6 (Mistralton Cave) | |||
 Moon Stone |
 Sun Stone |  Shiny Stone |  Dusk Stone |
| Route 3 (staw) | |||
 Dawn Stone |
|||
Route 2 (poziomy 55-60)
 |  |  |  |
| Nidoran+ | Nidoran+ | Granbull | Watchdog |
Route 3 (poziomy 55-60)
 |  |  |
| Manectric | Pachirisu | Zebstrika |
 |  |  |
| Venonat | Lombre | Bibarel |
Route 5 (poziomy 20-25)
 |  |  |
| Liepard | Minccino | Foongus |
Route 6 - blisko Pokemon Breeder (poziomy 25-30)
 |  | |
| Dunsparce | Woobat | Foongus |
Route 6 - Mistralton Cave (poziomy 25-30)
 | | |
| Nosepass | Woobat | Foongus |
Route 7 (poziom 30-35)
 |  | |  |
| Zangoose | Seviper | Watchog | Cubchoo |
Route 9 (poziom 35-40)
 | |  |  |
| Muk | Liepard | Garbodor | Bouffalant |
Route 13 (poziom 35-40)
 |  | |
| Spheal | Drifloon | Foongus |
 |  | |
| Tangela | Skorupi | Foongus |
Route 18 (poziom 55-60)
 |  |  |  |
| Kingler | Dragonite | Corsola | Chatot |
Route 22 (poziom 40-45; Mienfoo: 50-55)
 |  |  |
| Pelipper | Amoonguss | Mienfoo |
Route 23 (poziom 50-55)
 |  | | |  |
| Golduck | Gligar | Zangoose | Seviper | Absol |
Abundant Shrine przy Youngsterze - (poziom 35-40)
 |  | |
| Vulpix | Bronzor | Amoonguss |
Abundant Shrine (poziom 35-40)
|  | |
| Golduck | Swablu | Amoonguss |
Giant Chasm (poziom 45-50)
 |  |  |  |
| Cleafairy | Ditto | Sneasel | Metang |
Lostlorn Forest (poziom 20-25)
 |  |  |  |
| Pinsir | Heracross | Combee | Leavanny |
Pinwheel Forest (poziom 55-60)
 |  |  |  |
| Poliwhirl | Hariyama | Medicham | Bagon |
 |  |  |  | |
| Butterfree | Beedrill | Murkrow | Breloom | Amoonguss |
Floccesy Ranch (poziom 10-15)
 | |  |
| Marill | Dunsparce | Herdier |