Pokemon Battle Frontier to manga opowiadająca o chłopcu o imieniu Enta, który został zaproszony do Battle Frontier przez Scotta. Następnie istotę miejsca wyjaśnia mu Rald. Za jego sprawą główny bohater postanawia zmierzyć się z Frontier Brains.Manga kończy się na bitwie Enty z Anabel. Pomimo, że akcja rozgrywa się na obszarze znanym tam zarówno z gier i anime, nie pojawiają się tu tacy bohaterowie jak Noland, Greta czy Brandon. Jedyny tom serii został wydany w czerwcu 2005 w Japonii (kwiecień 2007 - Singapur), a narysowany przez Shihekatsu Iharę, odpowiedzialnego również za mangę Pokémon Diamond and Pearl Adventure!
Lista rozdziałów
- Rozdział 1: Enta Arrives at the Battle Frontier!
- Rozdział 2: Aim for the Top!
- Rozdział 3: Battle Between Student and Master!
- Rozdział 4: Introducing the Frontier Brains!
- Rozdział 5: The Predestined Battle!
- Rozdział 6: Final Battle: Versus The Salon Maiden