Fabuła tego filmu skupia się w okół małego i niepozornego Pokémon'a - Celebi, który jest nielada kąskiem dla kłusowników i kolekcjonerów. Przekonuje się o tym także młody trener Sammy, który ratuje Stworka przed zagrożeniem. Niestety, Trawiasty Pok instynktownie używa swych mocy, przenosząc się w przyszłość, razem ze swym wybawcą.

Czterdzieści lat później Sammy poznaje Ash'a, Misty i Brock'a, z którymi próbuje odszukać Mistycznego Stworka. Niestety, prawdziwe kłopoty dopiero się szykują, gdyż na scenę wkracza złowrogi Viscious, należący do Zespołu R, który przy użyciu najnowszych technologii stara się zdobyć Celebi'ego. Jego najsilniejszą bronią jest chyba Dark Ball, który potrafi zamienić najłagodniejszego Pokémon'a w prawdziwą bestię. Oczywiście, nie zabraknie również Jessie, James'a i Meowth'a, którzy usilnie starają się dogonić "kolegę po fachu". Kto pierwszy dotrze do Mistycznej istoty, czy będą to nasi bohaterowie, czy raczej czarne charaktery?

Film dopiero po 7 latach mogli oglądać nasi rodacy dzięki kanałowi Film Box.